Heatmap: Cluster_41 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	BHI	Basal Medium	CD196,BHI	CD196,Basal Medium	CD196,Log,BHI	ClnR mutant	LB-CD16	Log,BHI	LuxS KO	ND-CD12	ND-CD13	ND-CD17	R20291	R20291,BHI	R20291,Basal Medium	R20291,Heme+	R20291,Log	R20291,Log,BHI	Strain 630	Strain 630,BHI	Strain 630,Basal Medium	Strain 630,Faecal water+	Strain 630,HPUra+	Strain 630,Lag	Strain 630,Log	Strain 630,Log,BHI	Strain 630,Sporulating	TW11	UK1
CCL16956 (BN171_1030006)	0.06	0.01	0.13	0.04	0.13	0.31	0.3	0.05	0.03	0.7	0.47	0.55	0.63	0.23	0.03	1.0	0.28	0.11	0.13	0.01	0.01	0.0	0.14	0.04	0.13	0.01	0.03	0.31	0.59
CCL17136 (BN171_1300001)	1.0	0.19	0.55	0.11	0.21	0.54	0.22	0.43	0.44	0.5	0.46	0.48	0.55	0.59	0.13	0.72	0.36	0.3	0.35	0.6	0.16	0.72	0.42	0.47	0.41	0.25	0.07	0.63	0.44
CCL17158 (BN171_1330019)	0.02	0.02	0.02	0.03	0.0	1.0	0.27	0.01	0.47	0.29	0.24	0.28	0.64	0.02	0.01	0.69	0.14	0.01	0.27	0.1	0.08	0.0	0.57	0.2	0.39	0.04	0.08	0.63	0.3
CCL17246 (BN171_1410008)	0.73	0.28	0.7	0.56	0.75	0.44	0.78	0.34	0.28	0.76	0.99	0.72	0.6	0.91	0.33	0.64	0.59	0.61	0.39	1.0	0.91	0.35	0.59	0.38	0.55	0.7	0.11	0.5	0.9
CCL17356 (xseB)	0.09	0.06	0.27	0.19	0.43	0.49	0.65	0.11	0.44	1.0	0.78	0.66	0.42	0.5	0.11	0.36	0.36	0.13	0.48	0.75	0.25	0.02	0.82	0.34	0.49	0.19	0.1	0.55	0.77
CCL17507 (BN171_1520025)	0.21	0.24	0.24	0.22	0.18	0.44	0.58	0.15	0.99	1.0	0.82	0.8	0.92	0.22	0.2	0.66	0.38	0.2	0.42	0.36	0.29	0.25	0.58	0.64	0.58	0.15	0.24	0.45	0.77
CCL17519 (BN171_1520037)	0.24	0.05	0.33	0.13	0.16	0.56	0.59	0.08	0.45	0.69	0.52	0.62	0.89	0.41	0.08	1.0	0.39	0.18	0.71	0.4	0.17	0.15	0.83	0.56	0.82	0.21	0.08	0.83	0.59
CCL17571 (BN171_1570004)	0.69	0.26	0.76	0.33	0.3	0.56	0.42	0.26	0.44	0.35	0.33	0.35	0.61	0.69	0.25	1.0	0.34	0.39	0.28	0.85	0.33	0.25	0.46	0.45	0.4	0.24	0.14	0.67	0.29
CCL17578 (BN171_1590002)	0.16	0.04	0.19	0.15	0.17	0.53	0.9	0.05	0.93	0.95	0.71	0.74	0.93	0.25	0.1	1.0	0.35	0.16	0.42	0.27	0.19	0.24	0.6	0.78	0.7	0.08	0.16	0.86	0.63
CCL17579 (BN171_1590003)	0.1	0.04	0.16	0.16	0.19	0.23	0.76	0.02	0.24	0.81	0.58	0.73	0.77	0.18	0.08	1.0	0.42	0.12	0.36	0.22	0.18	0.1	0.43	0.26	0.31	0.1	0.15	0.51	0.55
CCL17580 (ddl)	0.04	0.02	0.05	0.05	0.08	0.29	0.6	0.05	0.05	0.86	0.63	0.83	0.65	0.05	0.04	1.0	0.47	0.08	0.3	0.09	0.05	0.12	0.26	0.08	0.39	0.09	0.27	0.6	0.68
CCL17623 (BN171_1640013)	0.61	0.1	0.73	0.4	0.41	0.46	0.3	0.21	0.48	0.4	0.4	0.41	0.64	1.0	0.13	0.89	0.38	0.26	0.43	0.57	0.17	0.13	0.84	0.24	0.33	0.19	0.16	0.35	0.4
CCL17672 (BN171_1670004)	0.16	0.16	0.18	0.29	0.16	0.08	0.33	0.19	0.08	0.18	0.14	0.25	0.57	0.19	0.21	1.0	0.25	0.22	0.07	0.13	0.2	0.14	0.09	0.11	0.18	0.09	0.07	0.18	0.15
CCL17720 (BN171_1720001)	0.01	0.01	0.42	0.06	0.08	0.21	0.3	0.01	0.06	0.26	0.2	0.26	0.28	0.14	0.01	0.55	0.2	0.02	0.16	1.0	0.14	0.04	0.42	0.17	0.22	0.06	0.23	0.36	0.19
CCL17741 (BN171_1750002)	0.31	0.23	0.25	0.52	0.29	0.1	1.0	0.31	0.22	0.65	0.45	0.51	0.56	0.27	0.34	0.46	0.26	0.27	0.33	0.2	0.25	0.35	0.29	0.31	0.31	0.18	0.07	0.44	0.43
CCL17808 (BN171_1810015)	0.31	0.28	0.48	1.0	0.56	0.18	0.38	0.14	0.86	0.5	0.34	0.35	0.76	0.35	0.49	0.66	0.31	0.34	0.43	0.38	0.44	0.61	0.7	0.72	0.57	0.2	0.15	0.27	0.28
CCL17809 (BN171_1810016)	0.25	0.26	0.37	0.79	0.41	0.13	1.0	0.22	0.28	0.57	0.69	0.89	0.76	0.23	0.39	0.35	0.35	0.32	0.44	0.16	0.31	0.19	0.83	0.71	0.27	0.08	0.12	0.28	0.6
CCL17847 (BN171_1840007)	0.02	0.0	0.07	0.07	0.05	0.34	0.57	0.01	0.06	0.82	0.8	0.88	0.5	0.06	0.01	0.68	0.23	0.03	0.28	0.06	0.08	0.04	0.4	0.2	0.26	0.01	0.08	0.6	1.0
CCL17920 (BN171_1940009)	0.01	0.01	0.1	0.09	0.05	0.34	0.34	0.01	0.45	0.39	0.37	0.36	0.67	0.11	0.03	1.0	0.22	0.02	0.31	0.18	0.19	0.01	0.3	0.32	0.3	0.03	0.03	0.41	0.4
CCL17921 (mobA)	0.19	0.05	0.36	0.82	0.29	0.8	0.6	0.05	0.16	0.52	0.43	0.48	0.71	0.28	0.39	1.0	0.5	0.19	0.45	0.61	0.88	0.1	0.43	0.5	0.51	0.4	0.11	0.62	0.41
CCL17922 (BN171_1940011)	0.19	0.02	0.28	0.23	0.16	0.99	0.42	0.04	0.3	0.51	0.42	0.63	0.77	0.23	0.09	1.0	0.24	0.1	0.46	0.29	0.23	0.05	0.59	0.5	0.69	0.15	0.06	0.48	0.52
CCL18042 (terD)	0.26	0.49	0.26	0.35	0.3	0.81	0.64	0.38	0.26	0.85	0.54	0.69	0.87	0.2	0.37	1.0	0.47	0.37	0.49	0.37	0.36	0.18	0.36	0.43	0.58	0.33	0.16	0.39	0.51
CCL18057 (BN171_2090001)	0.16	0.04	0.42	0.14	0.19	1.0	0.67	0.02	0.19	0.89	0.55	0.72	0.76	0.52	0.06	0.97	0.17	0.09	0.48	0.62	0.16	0.05	0.63	0.25	0.36	0.11	0.06	0.34	0.89
CCL18141 (BN171_2120001)	0.54	0.5	0.44	0.48	0.22	0.8	0.77	0.26	0.62	0.76	0.73	0.65	0.97	0.41	0.4	0.91	0.37	0.42	0.44	0.75	0.54	0.35	0.49	0.79	1.0	0.35	0.58	0.71	0.46
CCL18402 (BN171_2290007)	0.47	0.07	0.73	0.21	0.27	0.39	0.88	0.15	0.18	0.72	0.68	0.48	0.71	1.0	0.09	0.89	0.23	0.25	0.42	0.71	0.32	0.07	0.66	0.22	0.41	0.2	0.07	0.36	0.58
CCL18585 (BN171_2440026)	0.29	0.19	0.31	0.52	0.37	0.43	0.85	0.12	0.66	0.92	0.46	0.29	0.94	0.19	0.19	1.0	0.36	0.2	0.44	0.45	0.45	0.83	0.89	0.7	0.73	0.22	0.25	0.49	0.42
CCL18604 (cynT)	0.67	0.23	0.75	0.26	0.31	0.19	0.76	0.2	0.26	0.52	0.42	0.45	0.47	0.34	0.16	0.87	0.15	0.27	0.19	1.0	0.28	0.11	0.27	0.5	0.45	0.29	0.32	0.3	0.27
CCL18632 (BN171_2480007)	0.32	0.08	0.33	0.39	0.33	0.24	0.47	0.16	0.34	0.77	0.59	0.59	0.71	0.31	0.13	1.0	0.3	0.31	0.28	0.29	0.2	0.17	0.49	0.5	0.59	0.3	0.05	0.59	0.57
CCL18633 (BN171_2480008)	0.17	0.07	0.24	0.27	0.2	0.39	0.52	0.12	0.43	0.66	0.55	0.52	0.72	0.27	0.1	1.0	0.25	0.2	0.29	0.27	0.15	0.13	0.5	0.56	0.62	0.19	0.06	0.64	0.51
CCL18634 (BN171_2480009)	0.43	0.34	0.66	1.0	0.55	0.34	0.5	0.34	0.7	0.55	0.6	0.53	0.77	0.62	0.35	0.89	0.33	0.4	0.31	0.36	0.27	0.41	0.4	0.24	0.23	0.35	0.07	0.48	0.36
CCL18671 (BN171_2480046)	0.18	0.09	0.25	0.12	0.28	0.82	0.56	0.13	0.08	0.76	0.65	0.64	0.54	0.3	0.06	0.64	0.19	0.2	0.3	0.45	0.15	0.12	0.44	0.23	0.43	0.41	0.11	1.0	0.69
CCL18681 (BN171_2480056)	0.33	0.03	0.78	0.44	0.49	0.41	0.59	0.08	0.24	1.0	0.68	0.8	0.49	0.76	0.05	0.82	0.26	0.3	0.39	0.83	0.43	0.14	0.81	0.17	0.44	0.27	0.12	0.61	0.71
CCL18724 (BN171_2590012)	0.26	0.36	0.31	0.52	0.29	0.43	0.87	0.26	0.45	1.0	0.79	0.82	0.63	0.36	0.4	0.53	0.33	0.33	0.4	0.28	0.27	0.4	0.41	0.33	0.36	0.17	0.19	0.92	0.77
CCL18765 (BN171_2610005)	0.15	0.05	0.21	0.08	0.13	0.3	0.34	0.07	0.16	0.57	0.38	0.43	0.69	0.16	0.07	1.0	0.22	0.12	0.15	0.23	0.08	0.1	0.18	0.37	0.36	0.07	0.07	0.25	0.27
CCL18803 (BN171_2640002)	0.54	0.21	0.53	0.37	0.37	0.7	0.55	0.2	0.35	0.57	0.6	0.56	0.68	0.62	0.21	1.0	0.36	0.35	0.45	0.72	0.27	0.34	0.65	0.42	0.58	0.35	0.26	0.73	0.47
CCL18804 (polC)	0.18	0.03	0.49	0.24	0.33	0.56	0.63	0.05	0.47	0.79	0.91	0.84	0.67	0.5	0.11	1.0	0.29	0.17	0.37	0.83	0.39	0.1	0.61	0.32	0.47	0.25	0.16	0.77	0.72
CCL18831 (BN171_2670013)	0.18	0.15	0.21	0.2	0.2	0.48	0.43	0.11	0.12	0.48	0.25	0.6	0.45	0.16	0.07	0.64	0.17	0.16	0.32	0.41	0.27	0.22	0.27	0.2	0.2	0.2	0.16	1.0	0.16
CCL18844 (glyS)	0.5	0.31	0.42	0.29	0.32	0.34	0.53	0.26	0.17	0.88	0.86	0.78	0.75	0.39	0.28	1.0	0.39	0.32	0.39	0.43	0.28	0.39	0.6	0.36	0.63	0.24	0.47	0.82	0.8
CCL18849 (BN171_2690006)	0.36	0.2	0.34	0.3	0.27	0.55	1.0	0.15	0.13	0.9	0.83	0.77	0.68	0.36	0.22	0.81	0.28	0.25	0.47	0.46	0.31	0.5	0.77	0.38	0.55	0.28	0.26	0.68	0.69
CCL18959 (BN171_2770010)	0.37	0.37	0.29	0.49	0.36	0.3	1.0	0.35	0.43	0.68	0.71	0.75	0.63	0.2	0.34	0.8	0.32	0.34	0.45	0.2	0.34	0.57	0.61	0.68	0.54	0.18	0.2	0.37	0.57
CCL19127 (BN171_2870057)	0.02	0.0	0.18	0.14	0.08	0.32	0.25	0.0	1.0	0.52	0.34	0.28	0.44	0.12	0.01	0.34	0.09	0.03	0.46	0.13	0.07	0.14	0.77	0.68	0.63	0.04	0.06	0.59	0.22
CCL19156 (hpt)	0.1	0.01	0.16	0.06	0.19	0.31	0.41	0.04	0.12	0.66	0.88	0.76	0.61	0.17	0.03	0.9	0.39	0.11	0.25	0.26	0.08	0.04	0.45	0.45	0.57	0.16	0.06	0.75	1.0
CCL19306 (BN171_3020018)	0.45	0.21	0.52	0.24	0.33	0.32	0.53	0.31	0.09	0.95	1.0	0.58	0.39	0.44	0.19	0.52	0.3	0.43	0.31	0.74	0.2	0.07	0.85	0.39	0.65	0.38	0.08	0.58	0.5
CCL19334 (serS)	0.3	0.2	0.18	0.34	0.21	0.69	0.37	0.13	0.4	0.43	0.35	0.33	0.69	0.22	0.17	1.0	0.31	0.21	0.49	0.17	0.2	0.26	0.59	0.28	0.44	0.12	0.24	0.23	0.24
CCL19374 (BN171_3080021)	0.39	0.34	0.31	0.24	0.32	0.27	0.52	0.39	0.07	0.43	0.41	0.44	0.55	0.26	0.09	1.0	0.29	0.38	0.18	0.19	0.18	0.03	0.3	0.39	0.39	0.18	0.14	0.48	0.41
CCL19893 (BN171_3590014)	0.16	0.1	0.23	0.41	0.29	0.29	0.18	0.1	0.38	0.3	0.24	0.16	0.76	0.1	0.15	1.0	0.29	0.15	0.51	0.21	0.47	0.4	0.57	0.47	0.72	0.2	0.23	0.39	0.19
CCL19897 (BN171_3590018)	0.08	0.08	0.17	0.19	0.19	0.38	0.1	0.08	0.27	0.51	0.35	0.23	0.66	0.12	0.09	1.0	0.15	0.11	0.3	0.24	0.25	0.06	0.32	0.12	0.28	0.11	0.03	0.29	0.32
CCL20694 (BN171_930005)	0.47	0.11	0.42	0.22	0.27	0.21	0.43	0.17	0.17	0.42	0.32	0.49	0.67	0.44	0.2	1.0	0.22	0.42	0.26	0.37	0.14	0.28	0.31	0.21	0.56	0.18	0.07	0.4	0.33
CCL20695 (BN171_930006)	0.75	0.29	0.84	0.57	0.61	0.52	0.46	0.48	0.07	0.38	0.29	0.4	0.57	0.84	0.41	1.0	0.29	0.77	0.29	0.73	0.27	0.45	0.27	0.2	0.42	0.42	0.13	0.45	0.33
CCL20696 (BN171_930007)	0.4	0.08	0.38	0.2	0.34	0.36	0.61	0.15	0.09	0.58	0.57	0.69	0.67	0.53	0.1	1.0	0.16	0.32	0.4	0.6	0.2	0.17	0.5	0.25	0.54	0.26	0.07	0.35	0.49

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)